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DEXCS2018 for OpenFOAM(R) リリースノート

ダウンロードはこちら（2018/10/2〜）


DEXCS for OpenFOAM(R) は、OpenFOAMと、これをより簡単・高度に活用できるようにする為の様々なツールをすべてインストール済のオール・イン・ワンパッケージで、誰でも（と言ってもCAEに無縁の人は対象外ですが・・・）簡単・即使えるようにしたマシンイメージ（isoファイル）です。

詳しくはこちら

DEXCSランチャーのヘルプメニューからも参照できます

DEXCS2018では、

  • ベースOSはUbuntu-18.04 (LTS)
    • DEXCS2017まではMintを採用していましたが、再々度、Ubuntuに復帰しました（GNOMEデスクトップに戻った為）。
  • OpenFOAMやその他の組み込みツールのヴァージョンアップに対応
    • OpenFOAM-ｖ1806
    • cfMesh v1.1.2

（cfMeshはOpenFOAM-v1712以降、modules としてOpenFOAM本体に組み込まれています）

    • pyFoam は、OpenFOAM-ｖ1806への対応はアナウンスされておりません。DEXCSランチャーやTreeFoamで使っている機能（pyFoamPlotWatcher.pyやFoamCleaCase.pyなど）についてのみ動作確認しており、その他の機能については動作未確認です。
  • FreeCADマクロ（cfMesh用簡単設定ツール）は、これまでGUIコンポーネントをwxで作成していましたが、FreeCAD本体で使用しているQt4(pySyde)に変更しました。これにより、マクロ終了時のFreeCAD本体異常終了現象が解消されました。
  • DAKOTA（最適化ツール）の搭載は見送りました。
    • DAKOTAは、先の記事に示した通り同梱も可能でしたが、isoイメージに収納できる容量の問題と、GUIの使い方に十分な知識が必要になるので、不特定多数への配布は困難と考えました。DAKOTA有識者は、先の記事を参考に自身でインストールして使ってみて下さい。
  • DEXCSランチャーの「ヘルプ」⇒「ランチャの使い方」から参照できていたwinkチュートリアル（Flashコンテンツ）は廃止しました（セキュリティ上の問題でFirefoxで閲覧できなくなりました）。

インストールと利用法

詳しくはこちら（日本語と英語の切り替え方法も含む）


マシンイメージなので、DVDにイメージ書き込みすれば、DVDから起動してそのまま利用することができます。 （DEXCS初体験の人はこのライブDVDとして「まずは使ってみる」方法をお薦めします。）

  • 継続利用では起動後にインストール機能により、HDD等に直接インストールできる上、使用するユーザー名等を選択することができます。
  • VMWare Playerや、VirtualBox等の仮想環境で起動して、仮想環境を作成することも簡単です。
  • VirtualBoxにインストールする方法は、書籍「OpenFOAMによる熱移動と流れの数値解析」の付録AにDEXCS2015について詳しく記されていますが、基本は同じです。また、DEXCS2011までは、”Guest Additions”が入っておりませんでしたが、DEXCS2016では導入済みなので、共有ファイルの設定など（インストール方法メモの24〜26ページ）も同様に実施可能です。
  • 国際化対応のレベルはDEXCS2015に同じ（英語版のみに対応）ですが、日本語⇆英語のベース環境切り替え方法が、DEXCS2015に比べやや煩雑になっています。（インストール方法メモの8〜13ページ）
  • 一部動作に不具合が確認されています（インストール方法メモの14〜18ページ）。解決方法が見出だせませんでした。お判りの方、またこれ以外の不具合に気づかれた方はご連絡下さい。

同梱プログラム

その他のドキュメントについて

    • DEXCSランチャーのヘルプメニューを参照下さい。
    • Blender⇒SwiftツールをDEXCSランチャーから使用することはなくなりましたが、ツールそのものは使用可能で、メッシュ作成用のテンプレートフォルダもBlenderモデルと併せて同梱してあります(/opt/DEXCS/template/swift_dexcsMesh)。
    • Swiftツール使用法の詳細を知りたい方はDEXCS2013のリリースノートをご覧ください。
    • SLURMというリソースマネージャもインストールしてあり、サブミット用のサンプルスクリプトを含んだケースファイルも同梱してあります（/opt/DEXCS/template/slurm_damBreak）。コア数が４つのマシンであれば、以下のコマンドを、そのまま利用可能（のはず）です。
      • $ sbatch submit.sh 　（ジョブサブミット）
      • $ squeue 　（ジョブ確認）
      • $ scancel [jobID]　（ジョブ停止）
      • コア数が４でないなどの環境で、バッチジョブがペンディング状態のまま実行出来ない場合は、デスクトップ上、DEXCS/launcherOpen/doc/slurm.pdf を参考に設定ファイル（slurm.conf）を変更して使用して下さい。 （設定方法はこちら）
      • ジョブサブミット、ジョブ確認は、TreeFoamの十徳ナイフからも起動できます.
      • 上記を含めて、TreeFoamから起動する十徳ナイフのメニューに変更はありません。
    • JAVA gnuplot GUI　の使用方法
    • TreeFoamの基本的な使い方はTreeFoamのヘルプメニューから、「使い方」を参照して下さい。
    • TreeFoamに関する情報は、DEXCS公式HPの AboutTreeFoamの記事にまとめてあります。
    • DEXCS2018に搭載のTreeFOAMは、+dexcsSwakとして、上記公式ページに掲載ヴァージョンに対して独自のカスタマイズが加えてあります。

マルチブートUSBを使ってみよう

来週（12/7）実施予定のオープンCAEシンポジウム2017の講習会ではマルチブートUSBを使ってみようと、準備がほぼ完了しました。



Linuxマシンの場合、これまで外部モニタ（プロジェクタ）出力が困難だったんですが、DEXCSも2017（Linux Mint 18 / ubuntu 16.04）になって、出来そうになってきた（少なくとも何年か前に景品で貰ったモバイルプロジェクターでOKな）ので、自分が担当する講習（OpenFOAM中級：OpenFOAMに使用するメッシュ生成法）を、このUSBを使ってやってみようかと考えております。

USBブートは基本的にはライブモード（ユーザー名：custom）で使用することになります。通常のライブモードだと、電源オフとともに、それまでの作業履歴が完全に消滅しますが、このUSBの空き領域は、記憶領域として使用可能なので、ここで作業すれば、万一システムがオーバーロード等にてフリーズしても、リセットしてフリーズ前の状態からの再開も可能になる訳です。以下は、TreeFoamでの作業場所（rootDir）設定手順。但し、この手順はUSBブート専用にカスタマイズ可能かもしれませんが、今の所、起動の都度必要な作業になります。

お客さんの所に行った時に、お客さんのパソコンで動かして、気に入って貰えればそのままお客さんに使って貰っても良いということにもなります。

講習会の当日、また講習を受講できなかった人向けに実費販売あるかもしれませんので、興味のある方はシンポジウム事務局【symposium2017＠opencae.or.jp】またはオープンCAE学会事務局【office＠opencae.or.jp】 (大文字＠を小文字@に置換してください)にお問い合わせ下さい。

ちなみに今回作成したUSBは、16GB容量を使っており、isoイメージが２つ、講習会の全資料とケースファイル等一式が収納され、空き容量としては約8GBあります。

作成方法

約2年前の記事中の、Easy2BOOTで作成しております。現在は当時に比べてヴァージョンが上がっておりますが、基本的な使い方は同じでもあり、インストール不要のもっと簡単な使い方も出来るようになっています。

 

つまり、ダウンロードサイトから（１）入手した実行ファイルを（２）実行して、（３）ドライブと（４）言語を確認（５）ボタンを押すだけ。フォーマット方法や起動画面等オプションを変更したい場合は（5’）ボタン。

 

remote Server Access by DEXCS2017 for OpenFOAM(R)

DEXCS2017 for OpenFOAM(R) では、これまでのFOCUSだけでなく名大スパコン、その他のリモートサーバーへのアクセスが可能になりました。

但し、サーバー名やログイン情報などはユーザーさん自身でカスタマイズしてもらう必要があるので、以下にその方法を記しておきます（備忘録）。

準備は少々面倒ですが、これでリモートサーバーでの計算がかなり楽ちんになること請け合いです。

  1. 準備するもの（秘密鍵など）
  2. 準備その１（手動でアクセス確認）
  3. 準備その2（パスワード登録して自動アクセス）
  4. 準備その3（TreeFoam）
  5. 準備その4（サーバー側設定）
  6. 使ってみよう！
  7. 不具合情報


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DEXCS2017 for OpenFOAM(R) リリースノート

ダウンロードはこちら（2017/10/6よりOK）

不具合・更新情報



DEXCS for OpenFOAM(R) は、OpenFOAMと、これをより簡単・高度に活用できるようにする為の様々なツールをすべてインストール済のオール・イン・ワンパッケージで、誰でも（と言ってもCAEに無縁の人は対象外ですが・・・）簡単・即使えるようにしたマシンイメージ（isoファイル）です。

 

詳しくはこちら

DEXCSランチャーのヘルプメニューからも参照できます

DEXCS2017では、

  • ベースOSはLinux Mint 18 Xfce (LTS)
    • Mint 18 も Cinnamon⇒MATE⇒Xfce と試行の結果、これ（Xfce）が最も相性良さそうでした。
    • OSアップデートはしておりません。後述のWinkチュートリアルがFireFoxでの表示に不具合が生じる為。

OSアップデートを普通に実施すると、Winkチュートリアルを参照できなくなります。多分、FireFoxのアップデートを除外すれば大丈夫だとは思いますが確認していません。なお、Winkチュートリアルを参照できなくなった場合にも、Web版では参照可能です。

セキュリティの観点から、OSアップデートはした方が良いと思いますが、上記を読んで自己責任で実施して下さい。

  • OpenFOAMやその他の組み込みツールのヴァージョンアップに対応
    • OpenFOAM-ｖ1706
    • cfMesh v1.1.2

（但し、cfMeshはOpenFOAM-4.ｘ上で動作します。リリース時点で、cfMeshをOpenFOAM-ｖ1706上でコンパイル出来なかった為）

    • pyFoam は、OpenFOAM-ｖ1706への対応はアナウンスされておりません。DEXCSランチャーやTreeFoamで使っている機能（pyFoamPlotWatcher.pyやFoamCleaCase.pyなど）についてのみ動作確認しており、その他の機能については動作未確認です。
  • DEXCS2011から搭載するようになった中級者向けツール（TreeFoam）の機能強化を図りました。
    • FOCUSスパコン以外のサーバーでの作業もチャチャッと出来るようになりました。但し、個別のユーザー毎のカスタマイズは必要で、設定方法はこちら（左記リンクは旧ヴァージョン用で本ヴァージョン用は工事中）を参照下さい。
  • FreeCADマクロ（cfMesh用簡単設定ツール）を、より使い易くしました。2016年6月のオープンCAE学会総会付帯講習会にてお披露目したものです。
  • DEXCS2016より収録を再開したHELYX-OSですが、snappyHexMeshメッシュ作成、ソルバーではsimpleFoamが動作することは確認できています。
  • swak4Foam とDAKOTA（最適化ツール）の搭載は見送りました。
    • swak4FoamはOpenFOAM-ｖ1706上でコンパイル出来なかったことが主原因ですが、よく使っていた機能の多くがOpenFOAM本体にて実現できるようになってきたという理由もあります。
    • DAKOTAは、先の記事に示した通り同梱も可能でしたが、GUIの使い方に十分な知識が必要になるので、不特定多数への配布は困難と考えました。DAKOTA有識者は、先の記事を参考に自身でインストールして使ってみて下さい。
  • なお、DEXCS2012までは、32/64bit版がありましたが、DEXCS2013からは、64bit版のみです。
  • DEXCSランチャー等を含むDEXCSフォルダを、従来デスクトップ上に配置していたものを、本ヴァージョンより、/opt/下に変更しました（パッケージ化を狙ってますが、まだ出来ていません）。

 

インストールと利用法

詳しくはこちら（日本語と英語の切り替え方法も含む）


マシンイメージなので、DVDにイメージ書き込みすれば、DVDから起動してそのまま利用することができます。 （DEXCS初体験の人はこのライブDVDとして「まずは使ってみる」方法をお薦めします。）

  • 起動後にインストール機能により、HDD等に直接インストールできる上、使用するユーザー名等を選択することができます。
  • VMWare Playerや、VirtualBox等の仮想環境で起動して、仮想環境を作成することも簡単です。
  • VirtualBoxにインストールする方法は、書籍「OpenFOAMによる熱移動と流れの数値解析」の付録AにDEXCS2015について詳しく記されていますが、基本は同じです。また、DEXCS2011までは、”Guest Additions”が入っておりませんでしたが、DEXCS2016では導入済みなので、共有ファイルの設定など（インストール方法メモの25〜27ページ）も同様に実施可能です。
  • 国際化対応のレベルはDEXCS2015に同じ（英語版のみに対応）ですが、日本語⇆英語のベース環境切り替え方法が、DEXCS2015に比べやや煩雑になっています。（インストール方法メモの9〜15ページ）
  • 一部動作に不具合が確認されています（インストール方法メモの21ページ）。解決方法が見出だせませんでした。お判りの方、またこれ以外の不具合に気づかれた方はご連絡下さい。

同梱プログラム

その他のドキュメントについて

    • DEXCSランチャーのヘルプメニューを参照下さい。
      • 本当に初めて使う人は、「ランチャーの使い方」-「まずは使ってみる」（本記事、冒頭の約10分間アニメーション）をご覧下さい。
      • 「ランチャーの使い方」-「形状作成」にて、FreeCADの使い方を概略説明しています。
      • 「ランチャーの使い方」-「メッシュ」にて、FreeCADマクロで起動される表形式のGUIの使い方と、cfMesh作成に必要なパラメタの概要を説明しています。
      • 「ランチャーの使い方」-「計算実行」「結果処理」を理解できるようになると、OpenFOAMの基本的なファイル構造を理解できたことにもなります。
      • 以上は動画チュートリアルになっていますが、「フラッシュプレーヤー」を変更して参照することを強くお勧めします。変更方法は、最下段の「フラッシュプレーヤーの変更方法」をご覧ください。
    • Blender⇒SwiftツールをDEXCSランチャーから使用することはなくなりましたが、ツールそのものは使用可能で、メッシュ作成用のテンプレートフォルダもBlenderモデルと併せて同梱してあります(/opt/DEXCS/template/swift_dexcsMesh)。
    • Swiftツール使用法の詳細を知りたい方はDEXCS2013のリリースノートをご覧ください。
    • SLURMというリソースマネージャもインストールしてあり、サブミット用のサンプルスクリプトを含んだケースファイルも同梱してあります（/opt/DEXCS/template/slurm_damBreak）。コア数が４つのマシンであれば、以下のコマンドを、そのまま利用可能（のはず）です。
      • $ sbatch submit.sh 　（ジョブサブミット）
      • $ squeue 　（ジョブ確認）
      • $ scancel [jobID]　（ジョブ停止）
      • コア数が４でないなどの環境で、バッチジョブがペンディング状態のまま実行出来ない場合は、デスクトップ上、DEXCS/launcherOpen/doc/slurm.pdf を参考に設定ファイル（slurm.conf）を変更して使用して下さい。 （設定方法はこちら）
      • ジョブサブミット、ジョブ確認は、TreeFoamの十徳ナイフからも起動できます.
      • 上記を含めて、TreeFoamから起動する十徳ナイフのメニューに変更はありません。
    • JAVA gnuplot GUI　の使用方法
    • TreeFoamの基本的な使い方はTreeFoamのヘルプメニューから、「使い方」を参照して下さい。
    • TreeFoamに関する情報は、DEXCS公式HPの AboutTreeFoamの記事にまとめてあります。
    • DEXCS2017に搭載のTreeFOAMは、+dexcsSwakとして、上記公式ページに掲載ヴァージョンに対して独自のカスタマイズが加えてあります。%e7%af%84%e5%9b%b2%e3%82%92%e9%81%b8%e6%8a%9e_612
    • また、これに関連し、一部の機能が無効になっています。%e7%af%84%e5%9b%b2%e3%82%92%e9%81%b8%e6%8a%9e_613

 

DakotaUI (GUI?) 版について

昨日（7/15）のオープンCAE勉強会＠関西にて発表した資料です。総枚数130という大作ですが、結論としては、、、

  • DEXCS（というかubuntu系Linux）上でDakotaUIを動かすにはソースコンパイル＋アルファが必要でしたが、なんとかなりました。
  • DakotaUIとは、
    • コマンドライン起動できるようにしたSimulationモデルに対して、その入出力パラメタとDakotaエンジンとの接続を、ウイザードGUIで容易化してくれるものであった（****FRONTIERのようなブロック接続ではない）。
    • 探索結果一覧表の自動作成やグラフ化機能があり、それなりに使えそう。
  • UI版での動作にはいくつか問題があり、これらを回避する為の手間は増えるが実用は可能(?)。
    • DakotaStudy変数切り出しカラム設定において、Linux版では入力ファイル形式を（ window形式）とし、保存時には（Linux形式）にする必要がある（Windows版では変換の必要無し）。
    • DajotaStudyファイル中、

      Interface / copy_file

      にディレクトリ識別子（/）が存在すると、プロジェクトの再ロードが出来なかったり、他項目のGUI編集が出来なくなる（Linux / Windows版共通）。

    • 他にもありそう・・・

ということで、次期DEXCS2017に搭載するかどうかの判断は微妙な状況です。

なお、本資料中で使用しているdakota-openfoam連携計算サンプルファイルを右のダウンロードコーナー（Latest Downloads）よりDL出来るようにしておきましたので、興味のある方は自身で体験していただき、上記判断に対するコメントなり、現時点で見つかっている上記問題点に対する改善策なり、新たな問題発見なりをレポートしていただければありがたいです。

また、インストールが面倒、、、でも試してみたいという方には。インストール済のDEXCS特別版も配布しますので、申し付けください。